Il semble que requiert forcément le subjonctif, qui est le mode du doute, de l'incertitude.
Mais attention, ne pas confondre avec il me semble que qui est suivi de l'indicatif.
- Il semble qu'il faille couper les cheveux en quatre dans le sens de la longueur.
- Il me semble qu'il faut mettre du beurre dans les épinards.
- Il semble que le chien perde ses poils.
- Il me semble que le chien a des puces.
CE QU'IL FAUT RETENIR
- Il semble que + subjonctif
- Il me semble que + indicatif
Exceptionnellement (il en fallait bien une...), si il semble que a le sens de « il est certain que , on met l'indicatif : « il semble qu'il est en vie » (Molière, Dom Juan, III, 6).
Sources : Dictionnaire des difficultés de la langue française